Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax9P47242 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax9P47242 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax9P47242 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pax9P47242 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax9P47242 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pax9P47242 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax9P47242 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pax9P47242 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax9P47242 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pax9P47242 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax9P47242 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax9P47242 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax9P47242 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax9P47242 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax9P47242 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax9P47242 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax9P47242 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pax9P47242 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pax9P47242 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pax9P47242 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pax9P47242 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax9P47242 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms