Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brcc3P46737 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brcc3P46737 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brcc3P46737 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brcc3P46737 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brcc3P46737 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brcc3P46737 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Brcc3P46737 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brcc3P46737 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brcc3P46737 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brcc3P46737 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brcc3P46737 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brcc3P46737 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brcc3P46737 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms