Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klf1P46099 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klf1P46099 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klf1P46099 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klf1P46099 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klf1P46099 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klf1P46099 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klf1P46099 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klf1P46099 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klf1P46099 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klf1P46099 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klf1P46099 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klf1P46099 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klf1P46099 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Klf1P46099 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klf1P46099 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klf1P46099 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klf1P46099 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klf1P46099 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klf1P46099 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klf1P46099 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klf1P46099 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Klf1P46099 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klf1P46099 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klf1P46099 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klf1P46099 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Klf1P46099 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klf1P46099 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klf1P46099 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klf1P46099 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Klf1P46099 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Klf1P46099 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Klf1P46099 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klf1P46099 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms