Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sdc2P43407 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sdc2P43407 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sdc2P43407 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sdc2P43407 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sdc2P43407 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sdc2P43407 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sdc2P43407 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sdc2P43407 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sdc2P43407 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sdc2P43407 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sdc2P43407 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sdc2P43407 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sdc2P43407 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sdc2P43407 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sdc2P43407 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms