Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NodalP43021 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NodalP43021 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NodalP43021 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NodalP43021 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NodalP43021 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NodalP43021 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NodalP43021 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NodalP43021 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NodalP43021 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NodalP43021 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NodalP43021 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NodalP43021 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NodalP43021 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NodalP43021 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NodalP43021 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NodalP43021 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NodalP43021 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NodalP43021 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NodalP43021 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NodalP43021 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NodalP43021 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NodalP43021 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NodalP43021 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NodalP43021 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NodalP43021 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NodalP43021 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NodalP43021 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NodalP43021 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NodalP43021 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NodalP43021 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NodalP43021 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NodalP43021 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NodalP43021 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NodalP43021 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NodalP43021 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NodalP43021 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NodalP43021 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NodalP43021 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NodalP43021 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NodalP43021 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NodalP43021 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NodalP43021 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NodalP43021 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NodalP43021 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NodalP43021 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NodalP43021 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NodalP43021 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NodalP43021 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NodalP43021 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NodalP43021 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NodalP43021 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NodalP43021 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NodalP43021 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NodalP43021 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NodalP43021 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NodalP43021 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NodalP43021 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NodalP43021 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NodalP43021 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NodalP43021 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NodalP43021 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NodalP43021 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NodalP43021 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NodalP43021 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NodalP43021 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NodalP43021 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NodalP43021 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NodalP43021 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NodalP43021 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NodalP43021 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NodalP43021 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NodalP43021 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NodalP43021 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NodalP43021 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NodalP43021 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NodalP43021 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NodalP43021 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NodalP43021 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NodalP43021 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NodalP43021 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NodalP43021 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NodalP43021 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NodalP43021 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NodalP43021 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NodalP43021 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NodalP43021 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NodalP43021 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NodalP43021 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NodalP43021 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NodalP43021 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NodalP43021 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NodalP43021 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NodalP43021 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NodalP43021 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NodalP43021 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NodalP43021 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NodalP43021 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NodalP43021 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NodalP43021 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms