Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox6P40645 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox6P40645 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox6P40645 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox6P40645 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox6P40645 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox6P40645 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox6P40645 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox6P40645 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox6P40645 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox6P40645 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox6P40645 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox6P40645 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox6P40645 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox6P40645 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox6P40645 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox6P40645 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox6P40645 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox6P40645 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms