Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lig1P37913 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lig1P37913 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lig1P37913 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lig1P37913 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lig1P37913 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lig1P37913 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lig1P37913 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lig1P37913 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lig1P37913 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lig1P37913 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lig1P37913 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lig1P37913 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lig1P37913 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lig1P37913 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lig1P37913 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lig1P37913 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Lig1P37913 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lig1P37913 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lig1P37913 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lig1P37913 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lig1P37913 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lig1P37913 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lig1P37913 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lig1P37913 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lig1P37913 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lig1P37913 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lig1P37913 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lig1P37913 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lig1P37913 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lig1P37913 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lig1P37913 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lig1P37913 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lig1P37913 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lig1P37913 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lig1P37913 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms