Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpargP37238 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpargP37238 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PpargP37238 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PpargP37238 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpargP37238 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PpargP37238 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpargP37238 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpargP37238 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PpargP37238 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PpargP37238 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PpargP37238 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PpargP37238 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PpargP37238 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PpargP37238 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PpargP37238 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PpargP37238 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PpargP37238 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PpargP37238 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PpargP37238 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PpargP37238 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PpargP37238 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PpargP37238 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PpargP37238 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PpargP37238 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PpargP37238 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PpargP37238 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PpargP37238 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PpargP37238 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PpargP37238 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PpargP37238 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PpargP37238 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PpargP37238 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PpargP37238 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PpargP37238 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpargP37238 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpargP37238 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PpargP37238 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PpargP37238 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PpargP37238 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PpargP37238 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PpargP37238 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PpargP37238 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PpargP37238 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PpargP37238 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PpargP37238 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PpargP37238 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PpargP37238 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpargP37238 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpargP37238 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpargP37238 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PpargP37238 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PpargP37238 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PpargP37238 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PpargP37238 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PpargP37238 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PpargP37238 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PpargP37238 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PpargP37238 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PpargP37238 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PpargP37238 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PpargP37238 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PpargP37238 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpargP37238 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpargP37238 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpargP37238 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PpargP37238 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PpargP37238 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PpargP37238 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PpargP37238 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PpargP37238 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PpargP37238 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PpargP37238 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PpargP37238 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PpargP37238 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PpargP37238 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PpargP37238 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PpargP37238 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PpargP37238 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PpargP37238 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PpargP37238 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PpargP37238 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PpargP37238 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PpargP37238 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PpargP37238 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PpargP37238 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PpargP37238 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PpargP37238 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PpargP37238 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PpargP37238 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PpargP37238 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PpargP37238 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PpargP37238 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PpargP37238 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PpargP37238 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PpargP37238 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PpargP37238 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PpargP37238 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PpargP37238 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PpargP37238 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms