Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 LCP5YER127W 1074 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 ABZ2YMR289W 1125 nt11.54□□□□□ -0.56
CSE4P36012 NAS2YIL007C 663 nt11.52□□□□□ -0.57
CSE4P36012 IPL1YPL209C 1104 nt11.52□□□□□ -0.57
CSE4P36012 YDR455CYDR455C 309 nt11.51□□□□□ -0.57
CSE4P36012 BUR6YER159C 429 nt11.51□□□□□ -0.57
CSE4P36012 TAT2YOL020W 1779 nt11.51□□□□□ -0.57
CSE4P36012 POP2YNR052C 1302 nt11.5□□□□□ -0.57
CSE4P36012 SPP2YOR148C 558 nt11.49□□□□□ -0.57
CSE4P36012 YCR025CYCR025C 411 nt11.48□□□□□ -0.57
CSE4P36012 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.48□□□□□ -0.57
CSE4P36012 URH1YDR400W 1023 nt11.47□□□□□ -0.57
CSE4P36012 RRT8YOL048C 1029 nt11.47□□□□□ -0.57
CSE4P36012 KRE1YNL322C 942 nt11.46□□□□□ -0.57
CSE4P36012 RPC82YPR190C 1965 nt11.46□□□□□ -0.58
CSE4P36012 SWM1YDR260C 513 nt11.45□□□□□ -0.58
CSE4P36012 TOM20YGR082W 552 nt11.45□□□□□ -0.58
CSE4P36012 ACO2YJL200C 2370 nt11.44□□□□□ -0.58
CSE4P36012 ACH1YBL015W 1581 nt11.44□□□□□ -0.58
CSE4P36012 LYS20YDL182W 1287 nt11.42□□□□□ -0.58
CSE4P36012 QDR2YIL121W 1629 nt11.42□□□□□ -0.58
CSE4P36012 ADE8YDR408C 645 nt11.41□□□□□ -0.58
CSE4P36012 TVP23YDR084C 600 nt11.4□□□□□ -0.58
CSE4P36012 THP3YPR045C 1413 nt11.4□□□□□ -0.58
CSE4P36012 CWC15YDR163W 528 nt11.39□□□□□ -0.59
CSE4P36012 PAB1YER165W 1734 nt11.39□□□□□ -0.59
CSE4P36012 FLX1YIL134W 936 nt11.39□□□□□ -0.59
CSE4P36012 ERG13YML126C 1476 nt11.38□□□□□ -0.59
CSE4P36012 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.38□□□□□ -0.59
CSE4P36012 INA1YLR413W 2028 nt11.37□□□□□ -0.59
CSE4P36012 ASP3-1YLR155C 1089 nt11.37□□□□□ -0.59
CSE4P36012 ASP3-2YLR157C 1089 nt11.37□□□□□ -0.59
CSE4P36012 ASP3-3YLR158C 1089 nt11.37□□□□□ -0.59
CSE4P36012 ASP3-4YLR160C 1089 nt11.37□□□□□ -0.59
CSE4P36012 SPE2YOL052C 1191 nt11.35□□□□□ -0.59
CSE4P36012 PHB2YGR231C 933 nt11.34□□□□□ -0.59
CSE4P36012 OPI3YJR073C 621 nt11.33□□□□□ -0.6
CSE4P36012 BUD20YLR074C 501 nt11.33□□□□□ -0.6
CSE4P36012 ADH3YMR083W 1128 nt11.32□□□□□ -0.6
CSE4P36012 VPS62YGR141W 1404 nt11.31□□□□□ -0.6
CSE4P36012 FSH2YMR222C 672 nt11.3□□□□□ -0.6
CSE4P36012 YOR325WYOR325W 474 nt11.3□□□□□ -0.6
CSE4P36012 SER2YGR208W 930 nt11.27□□□□□ -0.61
CSE4P36012 YMR007WYMR007W 381 nt11.27□□□□□ -0.61
CSE4P36012 SPT20YOL148C 1815 nt11.26□□□□□ -0.61
CSE4P36012 BMT5YIL096C 1011 nt11.26□□□□□ -0.61
CSE4P36012 YDL086WYDL086W 822 nt11.23□□□□□ -0.61
CSE4P36012 TPC1YGR096W 945 nt11.23□□□□□ -0.61
CSE4P36012 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt11.23□□□□□ -0.61
CSE4P36012 MOB1YIL106W 945 nt11.23□□□□□ -0.61
CSE4P36012 SRN2YLR119W 642 nt11.23□□□□□ -0.61
CSE4P36012 SAC7YDR389W 1965 nt11.23□□□□□ -0.61
CSE4P36012 FRE6YLL051C 2139 nt11.23□□□□□ -0.61
CSE4P36012 ENO2YHR174W 1314 nt11.21□□□□□ -0.61
CSE4P36012 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.21□□□□□ -0.61
CSE4P36012 CYC3YAL039C 810 nt11.21□□□□□ -0.61
CSE4P36012 BET2YPR176C 978 nt11.21□□□□□ -0.61
CSE4P36012 ILV3YJR016C 1758 nt11.21□□□□□ -0.62
CSE4P36012 AMF1YOR378W 1548 nt11.2□□□□□ -0.62
CSE4P36012 AIM1YAL046C 357 nt11.2□□□□□ -0.62
CSE4P36012 RCR1YBR005W 642 nt11.19□□□□□ -0.62
CSE4P36012 HTS1YPR033C 1641 nt11.18□□□□□ -0.62
CSE4P36012 CMP2YML057W 1815 nt11.17□□□□□ -0.62
CSE4P36012 DIG1YPL049C 1359 nt11.16□□□□□ -0.62
CSE4P36012 LSB6YJL100W 1824 nt11.16□□□□□ -0.62
CSE4P36012 CCT2YIL142W 1584 nt11.16□□□□□ -0.62
CSE4P36012 PCP1YGR101W 1041 nt11.15□□□□□ -0.62
CSE4P36012 YKR012CYKR012C 378 nt11.15□□□□□ -0.62
CSE4P36012 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.15□□□□□ -0.62
CSE4P36012 OPI10YOL032W 741 nt11.15□□□□□ -0.62
CSE4P36012 YPL041CYPL041C 624 nt11.15□□□□□ -0.62
CSE4P36012 YOR343CYOR343C 327 nt11.14□□□□□ -0.63
CSE4P36012 COG1YGL223C 1254 nt11.13□□□□□ -0.63
CSE4P36012 LEU2YCL018W 1095 nt11.13□□□□□ -0.63
CSE4P36012 SDS24YBR214W 1584 nt11.11□□□□□ -0.63
CSE4P36012 YNR064CYNR064C 873 nt11.11□□□□□ -0.63
CSE4P36012 TGA1tA(UGC)A 73 nt11.1□□□□□ -0.63
CSE4P36012 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt11.1□□□□□ -0.63
CSE4P36012 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt11.1□□□□□ -0.63
CSE4P36012 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt11.1□□□□□ -0.63
CSE4P36012 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt11.1□□□□□ -0.63
CSE4P36012 YGR210CYGR210C 1236 nt11.1□□□□□ -0.63
CSE4P36012 ENT4YLL038C 744 nt11.1□□□□□ -0.63
CSE4P36012 SRP102YKL154W 735 nt11.09□□□□□ -0.63
CSE4P36012 NAM8YHR086W 1572 nt11.08□□□□□ -0.64
CSE4P36012 HOL1YNR055C 1761 nt11.08□□□□□ -0.64
CSE4P36012 MUP1YGR055W 1725 nt11.07□□□□□ -0.64
CSE4P36012 FTH1YBR207W 1398 nt11.07□□□□□ -0.64
CSE4P36012 RPL12BYDR418W 498 nt11.07□□□□□ -0.64
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