Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PtprkP35822 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PtprkP35822 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PtprkP35822 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PtprkP35822 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
PtprkP35822 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PtprkP35822 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PtprkP35822 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PtprkP35822 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PtprkP35822 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PtprkP35822 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PtprkP35822 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PtprkP35822 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PtprkP35822 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PtprkP35822 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PtprkP35822 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.03
PtprkP35822 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PtprkP35822 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
PtprkP35822 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PtprkP35822 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PtprkP35822 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PtprkP35822 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PtprkP35822 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PtprkP35822 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PtprkP35822 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
PtprkP35822 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PtprkP35822 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PtprkP35822 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PtprkP35822 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PtprkP35822 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PtprkP35822 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PtprkP35822 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PtprkP35822 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PtprkP35822 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
PtprkP35822 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PtprkP35822 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PtprkP35822 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PtprkP35822 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PtprkP35822 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PtprkP35822 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PtprkP35822 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PtprkP35822 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PtprkP35822 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PtprkP35822 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PtprkP35822 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PtprkP35822 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PtprkP35822 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PtprkP35822 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PtprkP35822 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PtprkP35822 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PtprkP35822 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PtprkP35822 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PtprkP35822 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PtprkP35822 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PtprkP35822 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PtprkP35822 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PtprkP35822 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PtprkP35822 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PtprkP35822 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PtprkP35822 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PtprkP35822 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PtprkP35822 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PtprkP35822 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PtprkP35822 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
PtprkP35822 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PtprkP35822 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms