Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab23P35288 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab23P35288 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab23P35288 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab23P35288 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab23P35288 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab23P35288 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab23P35288 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab23P35288 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab23P35288 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab23P35288 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab23P35288 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab23P35288 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab23P35288 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab23P35288 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab23P35288 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab23P35288 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab23P35288 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab23P35288 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab23P35288 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab23P35288 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab23P35288 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab23P35288 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab23P35288 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms