Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa2P31245 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa2P31245 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxa2P31245 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa2P31245 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa2P31245 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxa2P31245 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxa2P31245 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa2P31245 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa2P31245 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa2P31245 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa2P31245 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa2P31245 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms