Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprmP28828 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprmP28828 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PtprmP28828 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprmP28828 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtprmP28828 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprmP28828 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PtprmP28828 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PtprmP28828 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtprmP28828 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprmP28828 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprmP28828 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprmP28828 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprmP28828 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PtprmP28828 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprmP28828 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PtprmP28828 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PtprmP28828 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PtprmP28828 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PtprmP28828 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtprmP28828 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PtprmP28828 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PtprmP28828 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PtprmP28828 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PtprmP28828 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PtprmP28828 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtprmP28828 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PtprmP28828 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PtprmP28828 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtprmP28828 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtprmP28828 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprmP28828 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtprmP28828 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PtprmP28828 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PtprmP28828 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PtprmP28828 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PtprmP28828 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PtprmP28828 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtprmP28828 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PtprmP28828 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PtprmP28828 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PtprmP28828 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprmP28828 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprmP28828 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PtprmP28828 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PtprmP28828 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PtprmP28828 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PtprmP28828 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
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