Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RxraP28700 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RxraP28700 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RxraP28700 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RxraP28700 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RxraP28700 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxraP28700 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxraP28700 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxraP28700 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxraP28700 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxraP28700 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxraP28700 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RxraP28700 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RxraP28700 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RxraP28700 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RxraP28700 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RxraP28700 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RxraP28700 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RxraP28700 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RxraP28700 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RxraP28700 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RxraP28700 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RxraP28700 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RxraP28700 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RxraP28700 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxraP28700 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxraP28700 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxraP28700 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxraP28700 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxraP28700 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxraP28700 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RxraP28700 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RxraP28700 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RxraP28700 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RxraP28700 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RxraP28700 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RxraP28700 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RxraP28700 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RxraP28700 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RxraP28700 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RxraP28700 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RxraP28700 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RxraP28700 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RxraP28700 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RxraP28700 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RxraP28700 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RxraP28700 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RxraP28700 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RxraP28700 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RxraP28700 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RxraP28700 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RxraP28700 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RxraP28700 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RxraP28700 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RxraP28700 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RxraP28700 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RxraP28700 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RxraP28700 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RxraP28700 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RxraP28700 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RxraP28700 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RxraP28700 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RxraP28700 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RxraP28700 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RxraP28700 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RxraP28700 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RxraP28700 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RxraP28700 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RxraP28700 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RxraP28700 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RxraP28700 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RxraP28700 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RxraP28700 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RxraP28700 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RxraP28700 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RxraP28700 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RxraP28700 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RxraP28700 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RxraP28700 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RxraP28700 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RxraP28700 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RxraP28700 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RxraP28700 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RxraP28700 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RxraP28700 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RxraP28700 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RxraP28700 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RxraP28700 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RxraP28700 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RxraP28700 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RxraP28700 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RxraP28700 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxraP28700 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RxraP28700 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RxraP28700 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RxraP28700 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RxraP28700 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RxraP28700 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RxraP28700 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RxraP28700 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms