Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nckap1P28660 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nckap1P28660 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nckap1P28660 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nckap1P28660 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nckap1P28660 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nckap1P28660 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nckap1P28660 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nckap1P28660 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms