Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Celf1P28659 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Celf1P28659 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Celf1P28659 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Celf1P28659 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Celf1P28659 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Celf1P28659 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Celf1P28659 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Celf1P28659 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Celf1P28659 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Celf1P28659 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Celf1P28659 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Celf1P28659 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Celf1P28659 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Celf1P28659 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Celf1P28659 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Celf1P28659 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Celf1P28659 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Celf1P28659 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Celf1P28659 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Celf1P28659 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Celf1P28659 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Celf1P28659 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Celf1P28659 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Celf1P28659 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Celf1P28659 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Celf1P28659 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Celf1P28659 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Celf1P28659 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms