Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atxn10P28658 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn10P28658 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn10P28658 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atxn10P28658 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atxn10P28658 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atxn10P28658 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms