Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apex1P28352 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apex1P28352 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apex1P28352 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apex1P28352 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apex1P28352 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Apex1P28352 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apex1P28352 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apex1P28352 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apex1P28352 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apex1P28352 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apex1P28352 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apex1P28352 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apex1P28352 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apex1P28352 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apex1P28352 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apex1P28352 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms