Protein–RNA interactions for Protein: P27671

Rasgrf1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrf1P27671 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasgrf1P27671 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasgrf1P27671 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasgrf1P27671 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasgrf1P27671 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasgrf1P27671 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasgrf1P27671 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rasgrf1P27671 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rasgrf1P27671 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasgrf1P27671 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasgrf1P27671 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms