Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd40lgP27548 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd40lgP27548 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd40lgP27548 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd40lgP27548 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd40lgP27548 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd40lgP27548 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms