Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PdgfraP26618 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PdgfraP26618 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfraP26618 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfraP26618 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PdgfraP26618 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfraP26618 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfraP26618 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms