Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmd7P26516 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd7P26516 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd7P26516 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd7P26516 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms