Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ChgaP26339 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ChgaP26339 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ChgaP26339 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ChgaP26339 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ChgaP26339 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ChgaP26339 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ChgaP26339 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ChgaP26339 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ChgaP26339 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ChgaP26339 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ChgaP26339 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ChgaP26339 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ChgaP26339 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ChgaP26339 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ChgaP26339 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ChgaP26339 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ChgaP26339 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ChgaP26339 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ChgaP26339 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ChgaP26339 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ChgaP26339 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ChgaP26339 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ChgaP26339 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ChgaP26339 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ChgaP26339 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ChgaP26339 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ChgaP26339 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ChgaP26339 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ChgaP26339 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ChgaP26339 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ChgaP26339 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ChgaP26339 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ChgaP26339 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ChgaP26339 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ChgaP26339 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ChgaP26339 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ChgaP26339 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ChgaP26339 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ChgaP26339 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms