Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra2P26048 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gabra2P26048 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gabra2P26048 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra2P26048 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra2P26048 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra2P26048 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms