Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf8P23611 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf8P23611 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf8P23611 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf8P23611 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Irf8P23611 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf8P23611 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf8P23611 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf8P23611 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf8P23611 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf8P23611 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf8P23611 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf8P23611 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf8P23611 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf8P23611 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf8P23611 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf8P23611 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf8P23611 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irf8P23611 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irf8P23611 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf8P23611 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf8P23611 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf8P23611 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf8P23611 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf8P23611 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf8P23611 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf8P23611 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irf8P23611 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irf8P23611 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf8P23611 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf8P23611 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irf8P23611 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf8P23611 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf8P23611 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms