Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsta3P23591 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tsta3P23591 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsta3P23591 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsta3P23591 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsta3P23591 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms