Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifrd1P19182 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ifrd1P19182 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifrd1P19182 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifrd1P19182 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifrd1P19182 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifrd1P19182 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms