Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SellP18337 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SellP18337 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SellP18337 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SellP18337 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SellP18337 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SellP18337 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SellP18337 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SellP18337 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SellP18337 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SellP18337 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SellP18337 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SellP18337 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SellP18337 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SellP18337 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SellP18337 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SellP18337 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SellP18337 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SellP18337 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SellP18337 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SellP18337 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SellP18337 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SellP18337 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SellP18337 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SellP18337 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SellP18337 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SellP18337 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SellP18337 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SellP18337 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SellP18337 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SellP18337 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SellP18337 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SellP18337 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SellP18337 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SellP18337 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SellP18337 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SellP18337 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SellP18337 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SellP18337 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SellP18337 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SellP18337 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SellP18337 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SellP18337 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SellP18337 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SellP18337 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SellP18337 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SellP18337 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SellP18337 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SellP18337 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SellP18337 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SellP18337 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SellP18337 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SellP18337 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SellP18337 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SellP18337 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SellP18337 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SellP18337 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SellP18337 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SellP18337 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SellP18337 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SellP18337 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SellP18337 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SellP18337 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SellP18337 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SellP18337 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SellP18337 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SellP18337 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SellP18337 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SellP18337 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SellP18337 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SellP18337 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SellP18337 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SellP18337 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SellP18337 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SellP18337 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SellP18337 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SellP18337 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SellP18337 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SellP18337 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SellP18337 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SellP18337 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SellP18337 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SellP18337 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SellP18337 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SellP18337 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SellP18337 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SellP18337 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SellP18337 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SellP18337 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SellP18337 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SellP18337 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SellP18337 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SellP18337 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SellP18337 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SellP18337 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SellP18337 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SellP18337 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SellP18337 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SellP18337 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SellP18337 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms