Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsdP18242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsdP18242 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsdP18242 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsdP18242 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsdP18242 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsdP18242 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtsdP18242 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsdP18242 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsdP18242 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsdP18242 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtsdP18242 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtsdP18242 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtsdP18242 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CtsdP18242 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtsdP18242 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtsdP18242 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtsdP18242 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtsdP18242 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsdP18242 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsdP18242 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtsdP18242 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsdP18242 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsdP18242 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsdP18242 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsdP18242 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsdP18242 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsdP18242 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsdP18242 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsdP18242 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsdP18242 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsdP18242 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsdP18242 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsdP18242 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsdP18242 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsdP18242 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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