Protein–RNA interactions for Protein: P18121

Prl3d1, Prolactin-3D1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d1P18121 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prl3d1P18121 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prl3d1P18121 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prl3d1P18121 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Prl3d1P18121 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prl3d1P18121 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prl3d1P18121 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Prl3d1P18121 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prl3d1P18121 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prl3d1P18121 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prl3d1P18121 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prl3d1P18121 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prl3d1P18121 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prl3d1P18121 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prl3d1P18121 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Prl3d1P18121 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prl3d1P18121 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prl3d1P18121 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prl3d1P18121 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms