Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nme1P15532 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme1P15532 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nme1P15532 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nme1P15532 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme1P15532 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nme1P15532 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme1P15532 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nme1P15532 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme1P15532 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme1P15532 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme1P15532 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme1P15532 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme1P15532 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme1P15532 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme1P15532 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme1P15532 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme1P15532 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms