Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf1P15314 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf1P15314 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf1P15314 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf1P15314 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf1P15314 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf1P15314 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf1P15314 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Irf1P15314 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf1P15314 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Irf1P15314 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf1P15314 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf1P15314 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms