Protein–RNA interactions for Protein: P13595

Ncam1, Neural cell adhesion molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncam1P13595 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncam1P13595 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncam1P13595 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncam1P13595 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncam1P13595 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncam1P13595 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncam1P13595 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncam1P13595 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms