Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctla2aP12399 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctla2aP12399 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctla2aP12399 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctla2aP12399 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctla2aP12399 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms