Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ctla2aP12399 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ctla2aP12399 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ctla2aP12399 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ctla2aP12399 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ctla2aP12399 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ctla2aP12399 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ctla2aP12399 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctla2aP12399 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ctla2aP12399 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ctla2aP12399 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctla2aP12399 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ctla2aP12399 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ctla2aP12399 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ctla2aP12399 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ctla2aP12399 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctla2aP12399 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctla2aP12399 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctla2aP12399 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctla2aP12399 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctla2aP12399 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctla2aP12399 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctla2aP12399 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctla2aP12399 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctla2aP12399 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctla2aP12399 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctla2aP12399 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctla2aP12399 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctla2aP12399 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctla2aP12399 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctla2aP12399 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctla2aP12399 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ctla2aP12399 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctla2aP12399 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctla2aP12399 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctla2aP12399 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctla2aP12399 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctla2aP12399 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctla2aP12399 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctla2aP12399 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctla2aP12399 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctla2aP12399 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ctla2aP12399 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctla2aP12399 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctla2aP12399 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctla2aP12399 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctla2aP12399 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctla2aP12399 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctla2aP12399 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ctla2aP12399 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctla2aP12399 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctla2aP12399 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctla2aP12399 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctla2aP12399 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctla2aP12399 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctla2aP12399 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctla2aP12399 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctla2aP12399 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctla2aP12399 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctla2aP12399 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctla2aP12399 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctla2aP12399 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctla2aP12399 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctla2aP12399 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctla2aP12399 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctla2aP12399 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctla2aP12399 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctla2aP12399 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctla2aP12399 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctla2aP12399 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctla2aP12399 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctla2aP12399 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctla2aP12399 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctla2aP12399 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctla2aP12399 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctla2aP12399 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctla2aP12399 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctla2aP12399 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctla2aP12399 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctla2aP12399 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctla2aP12399 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctla2aP12399 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctla2aP12399 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctla2aP12399 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctla2aP12399 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctla2aP12399 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctla2aP12399 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctla2aP12399 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctla2aP12399 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctla2aP12399 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctla2aP12399 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctla2aP12399 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctla2aP12399 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctla2aP12399 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctla2aP12399 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctla2aP12399 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctla2aP12399 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctla2aP12399 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctla2aP12399 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctla2aP12399 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms