Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spp1P10923 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spp1P10923 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Spp1P10923 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spp1P10923 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spp1P10923 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spp1P10923 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spp1P10923 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spp1P10923 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spp1P10923 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spp1P10923 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spp1P10923 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spp1P10923 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spp1P10923 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spp1P10923 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spp1P10923 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spp1P10923 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spp1P10923 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spp1P10923 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spp1P10923 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spp1P10923 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spp1P10923 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spp1P10923 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spp1P10923 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spp1P10923 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spp1P10923 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spp1P10923 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spp1P10923 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spp1P10923 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spp1P10923 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spp1P10923 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spp1P10923 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spp1P10923 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spp1P10923 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spp1P10923 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms