Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CatspereP0DP43 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CatspereP0DP43 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CatspereP0DP43 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CatspereP0DP43 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CatspereP0DP43 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CatspereP0DP43 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CatspereP0DP43 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CatspereP0DP43 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CatspereP0DP43 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CatspereP0DP43 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CatspereP0DP43 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CatspereP0DP43 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CatspereP0DP43 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CatspereP0DP43 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CatspereP0DP43 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms