Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csf3P09920 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csf3P09920 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csf3P09920 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csf3P09920 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csf3P09920 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf3P09920 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf3P09920 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3P09920 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3P09920 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf3P09920 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf3P09920 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3P09920 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3P09920 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csf3P09920 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3P09920 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3P09920 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3P09920 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3P09920 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3P09920 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf3P09920 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms