Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa5P09021 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa5P09021 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa5P09021 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa5P09021 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms