Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LtkP08923 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LtkP08923 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LtkP08923 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LtkP08923 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LtkP08923 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LtkP08923 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LtkP08923 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LtkP08923 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LtkP08923 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LtkP08923 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LtkP08923 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LtkP08923 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LtkP08923 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LtkP08923 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LtkP08923 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LtkP08923 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LtkP08923 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LtkP08923 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LtkP08923 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LtkP08923 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LtkP08923 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LtkP08923 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LtkP08923 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LtkP08923 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LtkP08923 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LtkP08923 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LtkP08923 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LtkP08923 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LtkP08923 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LtkP08923 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LtkP08923 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LtkP08923 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LtkP08923 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LtkP08923 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LtkP08923 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LtkP08923 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LtkP08923 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LtkP08923 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LtkP08923 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LtkP08923 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LtkP08923 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LtkP08923 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LtkP08923 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LtkP08923 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LtkP08923 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LtkP08923 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LtkP08923 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LtkP08923 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LtkP08923 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LtkP08923 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LtkP08923 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LtkP08923 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LtkP08923 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LtkP08923 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LtkP08923 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
LtkP08923 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LtkP08923 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LtkP08923 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LtkP08923 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LtkP08923 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LtkP08923 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LtkP08923 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LtkP08923 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LtkP08923 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LtkP08923 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LtkP08923 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LtkP08923 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LtkP08923 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LtkP08923 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LtkP08923 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtkP08923 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtkP08923 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtkP08923 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtkP08923 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LtkP08923 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LtkP08923 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LtkP08923 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LtkP08923 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LtkP08923 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LtkP08923 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LtkP08923 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LtkP08923 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LtkP08923 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LtkP08923 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LtkP08923 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LtkP08923 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LtkP08923 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LtkP08923 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtkP08923 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtkP08923 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtkP08923 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtkP08923 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LtkP08923 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LtkP08923 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LtkP08923 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LtkP08923 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LtkP08923 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LtkP08923 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LtkP08923 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms