Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9P06683 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9P06683 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9P06683 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9P06683 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9P06683 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9P06683 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9P06683 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9P06683 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9P06683 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9P06683 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9P06683 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9P06683 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9P06683 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9P06683 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9P06683 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9P06683 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9P06683 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9P06683 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9P06683 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9P06683 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9P06683 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C9P06683 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9P06683 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9P06683 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9P06683 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9P06683 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C9P06683 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9P06683 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9P06683 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9P06683 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9P06683 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9P06683 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9P06683 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9P06683 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C9P06683 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9P06683 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9P06683 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P06683 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P06683 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P06683 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P06683 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P06683 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P06683 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P06683 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P06683 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P06683 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P06683 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P06683 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P06683 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P06683 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P06683 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P06683 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P06683 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P06683 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P06683 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P06683 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P06683 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P06683 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9P06683 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9P06683 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9P06683 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P06683 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P06683 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P06683 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P06683 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P06683 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P06683 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P06683 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P06683 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P06683 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P06683 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P06683 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P06683 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P06683 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P06683 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P06683 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P06683 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P06683 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P06683 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9P06683 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9P06683 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9P06683 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9P06683 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9P06683 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9P06683 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9P06683 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9P06683 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9P06683 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9P06683 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9P06683 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9P06683 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9P06683 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9P06683 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9P06683 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9P06683 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9P06683 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9P06683 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9P06683 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9P06683 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.9 ms