Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01669 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01669 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01669 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01669 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01669 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01669 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01669 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01669 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01669 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01669 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01669 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01669 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01669 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01669 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01669 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01669 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01669 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01669 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01669 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01669 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01669 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01669 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01669 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01669 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01669 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01669 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01669 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01669 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01669 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01669 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01669 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01669 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01669 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01669 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
P01669 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01669 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01669 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01669 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P01669 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01669 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01669 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01669 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01669 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01669 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01669 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01669 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01669 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01669 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01669 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01669 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01669 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
P01669 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
P01669 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01669 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01669 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01669 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01669 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01669 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01669 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01669 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01669 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01669 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01669 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01669 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01669 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
P01669 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P01669 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01669 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01669 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01669 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01669 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01669 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01669 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01669 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01669 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01669 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01669 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01669 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01669 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01669 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
P01669 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01669 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
P01669 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01669 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01669 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01669 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01669 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01669 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01669 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01669 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01669 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01669 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01669 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01669 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01669 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01669 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01669 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01669 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
P01669 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms