Protein–RNA interactions for Protein: P01634

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01634 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01634 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01634 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01634 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01634 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01634 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01634 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01634 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01634 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01634 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01634 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01634 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01634 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01634 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
P01634 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01634 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01634 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01634 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01634 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01634 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01634 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01634 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
P01634 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01634 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
P01634 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01634 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P01634 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01634 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01634 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01634 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01634 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01634 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01634 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01634 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01634 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01634 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01634 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01634 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01634 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01634 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01634 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01634 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01634 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01634 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01634 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01634 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01634 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01634 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01634 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01634 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01634 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01634 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01634 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01634 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01634 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01634 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01634 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01634 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01634 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01634 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01634 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01634 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01634 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01634 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01634 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01634 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01634 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01634 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01634 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01634 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P01634 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01634 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01634 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01634 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P01634 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01634 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01634 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P01634 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01634 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01634 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01634 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01634 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01634 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01634 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01634 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01634 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01634 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01634 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01634 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01634 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01634 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P01634 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01634 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01634 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01634 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01634 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01634 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01634 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01634 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01634 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms