Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lancl1O89112 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lancl1O89112 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lancl1O89112 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lancl1O89112 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lancl1O89112 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lancl1O89112 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lancl1O89112 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lancl1O89112 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lancl1O89112 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lancl1O89112 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lancl1O89112 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lancl1O89112 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms