Protein–RNA interactions for Protein: O89023

Tpp1, Tripeptidyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpp1O89023 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpp1O89023 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpp1O89023 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpp1O89023 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpp1O89023 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tpp1O89023 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpp1O89023 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tpp1O89023 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpp1O89023 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpp1O89023 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpp1O89023 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpp1O89023 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpp1O89023 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpp1O89023 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms