Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Actn3O88990 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Actn3O88990 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Actn3O88990 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Actn3O88990 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn3O88990 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn3O88990 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn3O88990 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Actn3O88990 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn3O88990 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Actn3O88990 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn3O88990 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn3O88990 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Actn3O88990 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Actn3O88990 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Actn3O88990 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Actn3O88990 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms