Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShdO88834 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShdO88834 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShdO88834 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ShdO88834 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShdO88834 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShdO88834 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShdO88834 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ShdO88834 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShdO88834 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ShdO88834 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ShdO88834 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShdO88834 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShdO88834 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ShdO88834 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShdO88834 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShdO88834 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ShdO88834 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ShdO88834 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShdO88834 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ShdO88834 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShdO88834 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShdO88834 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShdO88834 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ShdO88834 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ShdO88834 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShdO88834 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ShdO88834 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShdO88834 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ShdO88834 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShdO88834 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShdO88834 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShdO88834 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ShdO88834 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ShdO88834 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ShdO88834 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ShdO88834 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ShdO88834 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ShdO88834 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ShdO88834 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ShdO88834 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ShdO88834 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ShdO88834 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ShdO88834 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ShdO88834 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ShdO88834 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ShdO88834 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ShdO88834 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ShdO88834 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ShdO88834 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ShdO88834 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ShdO88834 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ShdO88834 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ShdO88834 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ShdO88834 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ShdO88834 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ShdO88834 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShdO88834 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShdO88834 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShdO88834 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ShdO88834 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShdO88834 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShdO88834 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShdO88834 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ShdO88834 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ShdO88834 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ShdO88834 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ShdO88834 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShdO88834 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ShdO88834 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ShdO88834 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ShdO88834 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ShdO88834 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ShdO88834 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ShdO88834 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ShdO88834 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ShdO88834 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ShdO88834 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ShdO88834 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ShdO88834 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ShdO88834 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ShdO88834 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ShdO88834 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ShdO88834 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ShdO88834 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ShdO88834 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ShdO88834 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ShdO88834 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ShdO88834 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ShdO88834 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ShdO88834 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ShdO88834 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ShdO88834 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ShdO88834 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ShdO88834 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ShdO88834 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ShdO88834 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ShdO88834 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ShdO88834 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ShdO88834 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms