Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp2O88623 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp2O88623 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp2O88623 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp2O88623 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp2O88623 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp2O88623 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp2O88623 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp2O88623 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp2O88623 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp2O88623 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp2O88623 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp2O88623 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp2O88623 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp2O88623 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp2O88623 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp2O88623 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp2O88623 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp2O88623 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp2O88623 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp2O88623 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp2O88623 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms