Protein–RNA interactions for Protein: O88487

Dync1i2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i2O88487 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dync1i2O88487 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dync1i2O88487 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dync1i2O88487 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dync1i2O88487 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i2O88487 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dync1i2O88487 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dync1i2O88487 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dync1i2O88487 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms