Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IkbkbO88351 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IkbkbO88351 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IkbkbO88351 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IkbkbO88351 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IkbkbO88351 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IkbkbO88351 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IkbkbO88351 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IkbkbO88351 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IkbkbO88351 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IkbkbO88351 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IkbkbO88351 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IkbkbO88351 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IkbkbO88351 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms